Tak lama setelah itu, Buya Syafii langsung melanjutkan pendidikan S3 di Universitas Chicago, Amerika Serikat.
Baca Juga: Kronologi Anak Ridwan Kamil, Emmeril Khan Mumtadz Hilang di Sungai Swiss: Pencarian Terus Dilakukan
Ia fokus belajar di bidang Pemikiran Islam, dan resmi menyandang gelar Ph.D pada tahun 1983.
Setelah bersekolah di luar negeri sekian lama, Buya Syafii kembali ke Indonesia untuk mengamalkan ilmunya.
Ia sempat mengajar sebagai dosen Sejarah dan Kebudayaan Islam di UII, Yogyakarta pada 1964-1969.
Baca Juga: Kronologi Hilangnya Emmeril Khan Mumtadz Anak Ridwan Kamil di Sungai Aaree Swiss
Di saat yang sama, tepatnya pada tahun 1967-1969 Buya Syafii juga mengajar di IKIP Yogyakarta.
Buya Syafii juga diangkat sebagai profesor tamu di McGill University, Kanada, pada 1992-1994.
Gelar profesor juga ia sandang di IKIP Yogyakarta sebagai Profesor Filsafat pada tahun 1996.
Buya Ahmad Syafii Maarif menjadi petinggi di Muhammadiyah pada tahun 1995.